Bij een coloscopie worden de dikke darm en het einde van de dunne darm onderzocht. Dit onderzoek duurt gemiddeld een half uur. U moet zich thuis voorbereiden; meer informatie hierover is te vinden op de website. De procedure wordt meestal uitgevoerd onder verdoving, maar kan indien gewenst ook zonder verdoving plaatsvinden. 

Er zijn twee soorten sedatie (cfr infra): een 'roesje' waarbij u gemakkelijk wekbaar bent, of een diepere sedatie toegediend door de anesthesist, waarbij u enkel met een pijnprikkel wekbaar bent. De keuze voor de verdoving wordt bij het maken van de afspraak met u besproken. U kunt lichte hinder ervaren door het opblazen van de darm en de beweging van de endoscoop. 

Soms worden er biopsies genomen of poliepen verwijderd. Bij grote poliepen kunnen er risico's zijn op bloeding of perforatie. Deze complicaties kunnen meestal tijdens de procedure behandeld worden. 

Na de procedure wordt u naar de uitslaapruimte gebracht voor monitoring. De arts bespreekt de resultaten met u voordat u naar huis gaat.